Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tarbp1E9Q368 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms