Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms