Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20425E9Q035 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms