Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rsf1E9PWW9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms