Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3002E9PW72 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms