Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms