Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc175E9PVB3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms