Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde2E9PUP1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms