Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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