Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms