Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms