Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms