Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan5bB2RTN3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms