Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a6B1AVK5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms