Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms