Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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PtprsB0V2N1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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PtprsB0V2N1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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PtprsB0V2N1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprsB0V2N1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms