Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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