Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gbp4A4UUI3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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