Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabreA2AMW3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabreA2AMW3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms