Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms