Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms