Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cul4bA2A432 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cul4bA2A432 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms