Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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