Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubl3Q9Z2M6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms