Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms