Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ilf3Q9Z1X4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms