Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1Q9Z179 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1Q9Z179 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms