Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cldn9Q9Z0S7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cldn9Q9Z0S7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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