Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn1Q9Z0I7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn1Q9Z0I7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn1Q9Z0I7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms