Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AireQ9Z0E3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms