Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ5

Apip, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApipQ9WVQ5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApipQ9WVQ5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApipQ9WVQ5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms