Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PapolbQ9WVP6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms