Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms