Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Chst4Q9R1I1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms