Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcm1Q9R0L6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms