Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lamc3Q9R0B6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lamc3Q9R0B6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms