Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphs1Q9QZS7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nphs1Q9QZS7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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