Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms