Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms