Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptf1aQ9QX98 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptf1aQ9QX98 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms