Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cln8Q9QUK3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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