Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp1Q9JLK7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms