Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn15Q9JLG8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn15Q9JLG8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms