Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rfx5Q9JL61 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rfx5Q9JL61 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rfx5Q9JL61 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rfx5Q9JL61 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rfx5Q9JL61 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rfx5Q9JL61 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rfx5Q9JL61 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rfx5Q9JL61 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rfx5Q9JL61 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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