Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AatfQ9JKX4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AatfQ9JKX4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms