Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms