Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms