Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Riox1Q9JJF3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Riox1Q9JJF3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Riox1Q9JJF3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Riox1Q9JJF3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Riox1Q9JJF3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Riox1Q9JJF3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Riox1Q9JJF3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Riox1Q9JJF3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Riox1Q9JJF3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Riox1Q9JJF3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Riox1Q9JJF3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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