Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms