Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird1Q9JI57 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms